Enota za analizo makromolekul
Enota za analizo makromolekul nudi podporo raziskovalcem pri proučevanju lastnosti tako bioloških kot tudi sintetičnih makromolekul in molekulskih skupkov v raztopini. Enota omogoča spremljanje interakcij s polarizirano svetlobo, določitve molekulske mase makromolekul, velikosti molekul, razvejanosti, konformacije, zeta potenciala, vizualizacije fluorescenčnih makromolekul ter elementne analize pri spremljanju interakcij med makromolekulami in kovinami. Poleg vrhunskega znanja pri delu z zahtevnimi inštrumenti enota nudi tudi pomoč pri interpretaciji rezultatov.
Vodja enote:
Raziskovalna oprema v okviru enote:
Naziv opreme:
ICP/MS Perkin Elmer SCIEX-Elan DRC.
Skrbnik: prof. dr. Mitja Kolar
Namembnost:
S pomočjo induktivno sklopljene plazme z masno selektivno detekcijo – ICP/MS lahko v določenem koncentracijskem območju analiziramo večino kovin periodnega sistema.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Sistem za absorpcijsko in emisijsko spektropolarimetrijo.
Skrbnik: izr. prof. dr. San Hadži
Namembnost:
Spremljanje (strukturnih) lastnosti (bio)molekul v raztopinah preko njihove interakcije s polarizirano svetlobo.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Multi-detektorski GPC sistem.
Tekočinski kromatograf s kombinacijo detektorjev za UV, refrakcijski indeks, sipanje svetlobe in viskoznost.
Skrbnik: izr. prof. dr Aleš Ručigaj
Namembnost:
Analizni sistem za določanje molekulskih mas, porazdelitve molekulskih mas, velikosti molekul, razvejenosti in konformacije.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Visokozmogljivi fluorescenčni mikroskop za biološko analizo kemijskih spojin
Skrbnik: doc. dr. Vera Župunski
Namembnost:
• vizualizacija fluorescenčnih makromolekul ali molekul, označenih s fluorescenčnimi barvili, njihove lokalizacije in kolokalizacije v celicah.
• Vizualizacija neobarvanih vzorcev z metodo DIC (Differential Interference Contrast).
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Sistem za kromatografijo bioloških makromolekul, sklopljen z naprednim karakterizacijskim sistemom
Skrbnik: izr. prof. dr. Miha Pavšič
Namembnost:
Oprema je sestavljena iz dveh glavnih delov:
• kromatografskega sistema in
• naprednega karakterizacijskega sistema.
Kromatografski sistem omogoča visokoločljivostno analitično in preparativno tekočinsko kromatografijo bioloških makromolekul z uporabo različnih tehnik/mehanizmov ločevanja (afinitetna in ionsko-izmenjevalna kromatografija, gelska filtracija itd.). Detektorji: UV - absorbanca (280 nm), pH, prevodnost, temperatura.
Značilnosti karakterizacijskega sistema:
• črpalka z odstranjevalcem plinov,
• temperirana komora za kolono,
• avtomatski vzorčevalnik,
• detektor za refraktivni indeks,
• UV/Vis spektrometer,
• detektor za statično sipanje svetlobe pod majhnim/pravim kotom
(LALS/RALS),
• viskozimeter.
Omogoča določitev absolutne molekulske mase in distribucijo molekulskih mas, intrinzično viskoznost, koncentracijo, hidrodinamski radij in radij giracije.
Detektorski del karakterizacijskega sistema je povezljiv s kromatografskim sistemom, ima pa karakterizacijski sistem tudi ločeno črpalko in komoro za kolono, kar omogoča neodvisno delovanje.
Oba sistema sta računalniško krmiljena.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Laserski sistem za karakterizacijo nanodelcev v raztopinah in suspenzijah LitesizerTM 500
Skrbnik: prof. dr. Matija Tomšič
Namembnost:
Sistem LitesizerTM 500 omogoča določanje 6 različnih eksperimentalnih parametrov: velikosti, elektroforetske mobilnosti, zeta-potenciala in molekulske mase koloidnih delcev ter prepustnosti in lomnega količnika preiskovane raztopine. Opremljen je z:
• lasersko diodo s svetlobo valovne dolžine 658 nm in moči 40 mW,
• termostatsko enoto za izvajanje meritev v območju od 0 do 90 °C,
• modulom za izvajanje meritev DLS pri sipalnih kotih 15°, 90° in 175 °, na
vzorcih z minimalnim volumnom 12 µL,
• elektroforetskim modulom ELS za izvajanje meritev zeta-potenciala po
metodi cmPALS v območju ±600 mV na vzorcih z volumnom vsaj 50 µL,
maksimalno električno prevodnostjo do 200 mS cm-1, velikostjo delcev od
3,8 nm do 100 µm in mobilnostjo od 10-11 m2 V-1 s-1 do 2 x 10-7 m2 V-1
s-1,
• modulom za izvajanje SLS meritev pri sipalnem kotu 90°, na vzorcih z
minimalnim volumnom 15 µL in delci premera do 40 nm,
• modulom za merjenje prepustnosti vzorca z minimalnim volumnom 15 µL,
• modulom za merjenje lomnega količnika v območju od 1.28 do 1.50 za
svetlobo valovne dolžine 658 nm,
• pretočnim modulom za meritve med avtomatsko titracijo s kislino ali bazo
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Ultra visokoločljivostni tekočinski kromatograf s tandemsko masno spektrometrijo
Skrbnik: prof. dr. Matevž Pompe
Namembnost:
Oprema se uporablja pri raziskovanju in razvoju sodobnih separacijskih in sklopljenih tehnik. Tehnika UHPLC omogoča separacijo velikega števila analitov v vzorcih v neprimerno krajšem času kot konvencionalna HPLC. Hkrati pa detekcija s tandemskim MS analizatorjem omogoča tako kvalitativno kot tudi kvantitativno določitev analitov v zelo nizkem koncentracijskem območju (ppb, ppt nivoji).
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Krio presevni elektronski mikroskop Glacios
Skrbnik: izr. prof. dr. Miha Pavšič
Namembnost:
Krioelektronski mikroskop Glacios nam omogoča izvajanje treh glavnih krio tehnik: analiza posameznega delca, kriotomografija in sipanje elektronov na mikro kristalih. S pomočjo teh pristopov lahko opazujemo biološke molekule v skoraj naravnem okolju. Opazovanje ne-bioloških vzorcev je mogoče.
Mikroskop se nahaja na Kemijskem inštitutu.
Naziv opreme:
Mikrokalorimetrski sistem TAM IV z enoto za ITC (izotermno titracijsko kalorimetrijo)
Skrbnik: doc. dr. Bojan Šarac
Namembnost:
Merjenja toplotnih efektov pri različnih procesih (micelizacija in drugi procesi samourejanja, asociacija, mešanje,…) v vodnih in nevodnih medijih.
Dostopnost:
Zainteresirani uporabnik se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo eksperimentov. Cena je odvisna od zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Visokozmogljivi računalniški sistem (HPC) za izvajanje simulacij s področja kemije
Skrbnik: prof. dr. Jurij Reščič
Namembnost:
Računalniški sistem je namenjen simulacijam molekulske dinamike, kvantnomehanskim izračunom, molekulskemu sidranju in sorodne uporabe s podorčja kemije in kemijskega inženirstva.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Sistem za izotermno titracijsko kalorimetrijo
Odgovorna oseba: izr. prof. dr. San Hadži
Namembnost:
Spremljanje toplotnih efektov pri vezanju (makro)molekul v raztopinah.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Sistem za izvedbo pripravljalnih in zaključnih procesov proizvodnje rekombinantnih proteinov v laboratorijskem merilu
Skrbnik: doc. dr. Vera Župunski
Namembnost:
Sistem sestavljajo 4 sklopi: avtoklav, laboratorijski stresalnik za gojenje mikroorganizmov, naprava za verižno reakcijo s polimerazo in Dewarjeva posoda za shranjevanje trajnih kultur sesalskih celic.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom. Možna je tudi uporaba posameznih sklopov opreme.