Enota za analizo makromolekul
Enota za analizo makromolekul nudi podporo raziskovalcem pri proučevanju lastnosti tako bioloških kot tudi sintetičnih makromolekul in molekulskih skupkov v raztopini. Enota omogoča spremljanje interakcij s polarizirano svetlobo, določitve molekulske mase makromolekul, velikosti molekul, razvejanosti, konformacije, zeta potenciala, vizualizacije fluorescenčnih makromolekul ter elementne analize pri spremljanju interakcij med makromolekulami in kovinami. Poleg vrhunskega znanja pri delu z zahtevnimi inštrumenti enota nudi tudi pomoč pri interpretaciji rezultatov.
Vodja enote:
Raziskovalna oprema v okviru enote:
Naziv opreme:
ICP/MS Perkin Elmer SCIEX-Elan DRC.
Skrbnik: prof. dr. Mitja Kolar
Namembnost:
S pomočjo induktivno sklopljene plazme z masno selektivno detekcijo – ICP/MS lahko v določenem koncentracijskem območju analiziramo večino kovin periodnega sistema.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Sistem za absorpcijsko in emisijsko spektropolarimetrijo.
Skrbnik: izr. prof. dr. San Hadži
Namembnost:
Spremljanje (strukturnih) lastnosti (bio)molekul v raztopinah preko njihove interakcije s polarizirano svetlobo.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Multi-detektorski GPC sistem.
Tekočinski kromatograf s kombinacijo detektorjev za UV, refrakcijski indeks, sipanje svetlobe in viskoznost.
Skrbnik: izr. prof. dr Aleš Ručigaj
Namembnost:
Analizni sistem za določanje molekulskih mas, porazdelitve molekulskih mas, velikosti molekul, razvejenosti in konformacije.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Visokozmogljivi fluorescenčni mikroskop za biološko analizo kemijskih spojin
Skrbnik: doc. dr. Vera Župunski
Namembnost:
• vizualizacija fluorescenčnih makromolekul ali molekul, označenih s fluorescenčnimi barvili, njihove lokalizacije in kolokalizacije v celicah.
• Vizualizacija neobarvanih vzorcev z metodo DIC (Differential Interference Contrast).
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Sistem za kromatografijo bioloških makromolekul, sklopljen z naprednim karakterizacijskim sistemom
Skrbnik: izr. prof. dr. Miha Pavšič
Namembnost:
Oprema je sestavljena iz dveh glavnih delov:
• kromatografskega sistema in
• naprednega karakterizacijskega sistema.
Kromatografski sistem omogoča visokoločljivostno analitično in preparativno tekočinsko kromatografijo bioloških makromolekul z uporabo različnih tehnik/mehanizmov ločevanja (afinitetna in ionsko-izmenjevalna kromatografija, gelska filtracija itd.). Detektorji: UV - absorbanca (280 nm), pH, prevodnost, temperatura.
Značilnosti karakterizacijskega sistema:
• črpalka z odstranjevalcem plinov,
• temperirana komora za kolono,
• avtomatski vzorčevalnik,
• detektor za refraktivni indeks,
• UV/Vis spektrometer,
• detektor za statično sipanje svetlobe pod majhnim/pravim kotom
(LALS/RALS),
• viskozimeter.
Omogoča določitev absolutne molekulske mase in distribucijo molekulskih mas, intrinzično viskoznost, koncentracijo, hidrodinamski radij in radij giracije.
Detektorski del karakterizacijskega sistema je povezljiv s kromatografskim sistemom, ima pa karakterizacijski sistem tudi ločeno črpalko in komoro za kolono, kar omogoča neodvisno delovanje.
Oba sistema sta računalniško krmiljena.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Laserski sistem za karakterizacijo nanodelcev v raztopinah in suspenzijah LitesizerTM 500
Skrbnik: prof. dr. Matija Tomšič
Namembnost:
Sistem LitesizerTM 500 omogoča določanje 6 različnih eksperimentalnih parametrov: velikosti, elektroforetske mobilnosti, zeta-potenciala in molekulske mase koloidnih delcev ter prepustnosti in lomnega količnika preiskovane raztopine. Opremljen je z:
• lasersko diodo s svetlobo valovne dolžine 658 nm in moči 40 mW,
• termostatsko enoto za izvajanje meritev v območju od 0 do 90 °C,
• modulom za izvajanje meritev DLS pri sipalnih kotih 15°, 90° in 175 °, na
vzorcih z minimalnim volumnom 12 µL,
• elektroforetskim modulom ELS za izvajanje meritev zeta-potenciala po
metodi cmPALS v območju ±600 mV na vzorcih z volumnom vsaj 50 µL,
maksimalno električno prevodnostjo do 200 mS cm-1, velikostjo delcev od
3,8 nm do 100 µm in mobilnostjo od 10-11 m2 V-1 s-1 do 2 x 10-7 m2 V-1
s-1,
• modulom za izvajanje SLS meritev pri sipalnem kotu 90°, na vzorcih z
minimalnim volumnom 15 µL in delci premera do 40 nm,
• modulom za merjenje prepustnosti vzorca z minimalnim volumnom 15 µL,
• modulom za merjenje lomnega količnika v območju od 1.28 do 1.50 za
svetlobo valovne dolžine 658 nm,
• pretočnim modulom za meritve med avtomatsko titracijo s kislino ali bazo
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Ultra visokoločljivostni tekočinski kromatograf s tandemsko masno spektrometrijo
Skrbnik: prof. dr. Matevž Pompe
Namembnost:
Oprema se uporablja pri raziskovanju in razvoju sodobnih separacijskih in sklopljenih tehnik. Tehnika UHPLC omogoča separacijo velikega števila analitov v vzorcih v neprimerno krajšem času kot konvencionalna HPLC. Hkrati pa detekcija s tandemskim MS analizatorjem omogoča tako kvalitativno kot tudi kvantitativno določitev analitov v zelo nizkem koncentracijskem območju (ppb, ppt nivoji).
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Krio presevni elektronski mikroskop Glacios
Skrbnik: izr. prof. dr. Miha Pavšič
Namembnost:
Krioelektronski mikroskop Glacios nam omogoča izvajanje treh glavnih krio tehnik: analiza posameznega delca, kriotomografija in sipanje elektronov na mikro kristalih. S pomočjo teh pristopov lahko opazujemo biološke molekule v skoraj naravnem okolju. Opazovanje ne-bioloških vzorcev je mogoče.
Mikroskop se nahaja na Kemijskem inštitutu.
Naziv opreme:
Mikrokalorimetrski sistem TAM IV z enoto za ITC (izotermno titracijsko kalorimetrijo)
Skrbnik: doc. dr. Bojan Šarac
Namembnost:
Merjenja toplotnih efektov pri različnih procesih (micelizacija in drugi procesi samourejanja, asociacija, mešanje,…) v vodnih in nevodnih medijih.
Dostopnost:
Zainteresirani uporabnik se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo eksperimentov. Cena je odvisna od zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Sistem za izotermno titracijsko kalorimetrijo
Odgovorna oseba: izr. prof. dr. San Hadži
Namembnost:
Spremljanje toplotnih efektov pri vezanju (makro)molekul v raztopinah.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Storitve
Zainteresirani uporabnik naj se obrne na skrbnika opreme, ki organizira izvedbo meritev. Cena meritev je odvisna od narave vzorca, zahtevnosti eksperimentov in interpretacije podatkov. Informacijo o ceni dobite od skrbnika ob dogovoru za izvedbo eksperimentov.
Naziv opreme:
Visokozmogljivi računalniški sistem (HPC) za izvajanje simulacij s področja kemije
Skrbnik: prof. dr. Jurij Reščič
Namembnost:
Računalniški sistem je namenjen simulacijam molekulske dinamike, kvantnomehanskim izračunom, molekulskemu sidranju in sorodne uporabe s podorčja kemije in kemijskega inženirstva.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.
Naziv opreme:
Sistem za izvedbo pripravljalnih in zaključnih procesov proizvodnje rekombinantnih proteinov v laboratorijskem merilu
Skrbnik: doc. dr. Vera Župunski
Namembnost:
Sistem sestavljajo 4 sklopi: avtoklav, laboratorijski stresalnik za gojenje mikroorganizmov, naprava za verižno reakcijo s polimerazo in Dewarjeva posoda za shranjevanje trajnih kultur sesalskih celic.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom. Možna je tudi uporaba posameznih sklopov opreme.
Naziv opreme: Instrument za določanje stabilnosti proteinov
Skrbnik: izr. prof. dr. Miha Pavšič
Namembnost:
Instrument za določanje stabilnosti proteinov NanoTemper Prometheus Panta omogoča celovito karakterizacijo temperaturne konformacijske in koloidne stabilnosti proteinov. Združuje nano-diferenčno dinamično fluorimetrijo (nanoDSF) za spremljanje razvijanja proteinov pri povišani temperaturi preko merjenja intrinzične fluorescence triptofanskih ostankov ter statičnega (SLS) in dinamičnega sipanja svetlobe (DLS) za spremljanje velikosti delcev. SLS omogoča določitev temperature začetka agregacije, DLS pa hidrodinamski radij in distribucijo velikosti delcev. Te tehnike skupaj omogočajo multidimenzionalni vpogled v stabilnost vzorcev, ki je pomembna pri karakterizaciji proteinskih vzorcev za raziskave, proteinskem inženiringu in kontroli kvalitete.
Dostopnost:
Po dogovoru s skrbnikom.