FKKT

Biophysical Journal – ugledna revija s področja biofizike – poleg znanstvenih publikacij objavlja tudi prispevke 'novo in izpostavljeno', v katerih vodilni raziskovalci opozarjajo na pomembne in inovativne študije s področja biofizike. 

V zadnji številki je bil med posebej izpostavljenimi tudi članek raziskovalcev s Katedre za fizikalno kemijo Fakultete za kemijo in kemijsko tehnologijo Univerze v Ljubljani. Gre za raziskavo z naslovom »Sprememba konformacijske entropije proteinskega ogrodja pri tvorbi vijačnice« (angl. Backbone conformational entropy change in helix folding). V članku, ki je izšel v prvi januarski številki omenjene revije, so avtorji Uroš Zavrtanik, Jurij Lah in San Hadži opisali eksperimentalno določitev spremembe konformacijske entropije pri zvijanju proteinov. Ta je pomembna za razumevanje zvijanja in vezanja proteinov, kar je v neposredni povezavi z njihovo biološko funkcijo.

Prof. Hue Sun Chan, eden izmed pionirjev teoretičnih študij zvijanja proteinov, je v prispevku »Štetje konformacij s kalorimetrijo« (angl. Counting conformations by calorimetry) takole izpostavil pomembnost prispevka slovenskih raziskovalcev:

Spremembe konformacijske entropije proteinov ni mogoče neposredno določiti z eksperimentom, ker sprememba entropije, ki spremlja zvijanje, vključuje tudi prispevek hidratacije. V desetletjih teoretičnih in eksperimentalnih prizadevanj so različni avtorji predlagali med seboj bistveno različne ocene spremembe konformacijske entropije. 

Zavrtanik in sodelavci poročajo o inovativni uporabi diferenčne dinamične kalorimetrije (DSC) za oceno spremembe konformacijske entropije proteinov brez predpostavk o vplivu solvatacije. Izjemno je, da je vrednost spremembe entropije, določena z njihovim preprostim pristopom, podobna tisti, ki so jo drugi avtorji nedavno dobili na osnovi simulacij molekularne dinamike, kar povečuje možnost, da bomo dosegli soglasje o vrednosti te osnovne količine.

Več lahko preberete v prvi januarski številki revije Biophysical Journal.

Komentar – DOI: 10.1016/j.bpj.2025.11.2688

Raziskovalni članek – DOI: 10.1016/j.bpj.2025.11.2689